Dernier ancêtre commun universellang=fr|vignette|redresse=2|Un arbre phylogénétique hypothétique reliant tous les grands groupes d'organismes vivants au dernier ancêtre commun universel. Ce graphique est basé sur l'analyse de séquences d'ARN ribosomique. Le dernier ancêtre commun universel (DACU) est le plus récent organisme dont sont issues toutes les espèces vivant actuellement sur Terre. Le terme en anglais Last Universal Common Ancestor a pour acronyme LUCA. LUCA aurait été actif il y a d'années. Il ne doit pas être confondu avec le premier organisme vivant.
RhizobacteriaRhizobacteria are root-associated bacteria that can have a detrimental (parasitic varieties), neutral or beneficial effect on plant growth. The name comes from the Greek rhiza, meaning root. The term usually refers to bacteria that form symbiotic relationships with many plants (mutualism). Rhizobacteria are often referred to as plant growth-promoting rhizobacteria, or PGPRs. The term PGPRs was first used by Joseph W. Kloepper in the late 1970s and has become commonly used in scientific literature.
Anaerobic oxidation of methaneAnaerobic oxidation of methane (AOM) is a methane-consuming microbial process occurring in anoxic marine and freshwater sediments. AOM is known to occur among mesophiles, but also in psychrophiles, thermophiles, halophiles, acidophiles, and alkophiles. During AOM, methane is oxidized with different terminal electron acceptors such as sulfate, nitrate, nitrite and metals, either alone or in syntrophy with a partner organism.
ATPaseInfobox Enzyme | nom = Adénosinetriphosphatase | image = Proton ATPase cartoon overview.png | légende = Structure d'une pompe à protons demembrane plasmique dArabidopsis thaliana(d'après ) | EC = | CAS = | index = 3.6.1.3 | UIBMB = 3/6/1/3 | code GO = 0016887 Les ATPases membranaires sont une classe d'enzymes liées au métabolisme énergétique, qui hydrolysent ou synthétisent les molécules d'adénosine-triphosphate (ATP) tout en transférant des ions d'un côté à l'autre de la membrane.
Signal de localisation nucléaireUn signal de localisation nucléaire (SLN) ou NLS (de l'anglais Nuclear localization sequence) est une petite séquence d'acides aminés (8 à 10 acides aminés) qui cible les protéines vers le noyau de la cellule. Les protéines portant un signal de localisation nucléaire sont reconnues par la protéine importine dans le cytosol et sont guidées vers les pores nucléaires. La séquence de 8 à 10 acides aminés varie d'une protéine nucléaire à l'autre, mais elle est toujours riche en acides aminés chargés positivement (soit les acides aminés basiques : arginine, lysine, histidine).
RadiorésistanceEn biologie, la radiorésistance est la capacité de certains organismes à survivre dans des environnements soumis à de très importantes radiations ionisantes. En oncologie, la radiorésistance est un terme médical utilisé pour désigner la caractéristique des cellules cancéreuses difficiles à traiter avec la radiothérapie, phénomène souvent lié aux caractéristiques biologiques de ces cellules, mais qui peut aussi être partiellement dû à la sous-oxygénation des tumeurs.
Phosphoglycérideupright=1.75|vignette| Structure de différents glycérophospholipides. R1 et R2 représentent deux chaînes latérales d'acide gras, Z étant un résidu de molécule polaire. upright=1.75|vignette|alt=Formule développée d'un phosphoglycérolipide|Formule développée d'une phosphatidylcholine typique : 1. choline, 2. phosphate, 3. glycérol, 4. acide gras insaturé en C2 du résidu, 5. acide gras saturé en C1 du résidu glycérol.
Bacille (forme)Un bacille est une bactérie de forme allongée dite « en bâtonnet » — du latin baculus ou baculum, bâton — par opposition à la forme cocci (« ronde »). La forme des bactéries et la coloration de Gram sont des critères permettant de les classer. Le bacille de Koch : bactérie qui est responsable de la tuberculose. Il s'infiltre dans l'organisme par les voies respiratoires, et se développe dans les os, les reins, la peau, les méninges, mais le plus souvent dans les poumons.
ProkaryotaUn procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries). Les procaryotes actuels sont les bactéries et les archées. Les Prokaryota ne constituent pas un taxon valide du point de vue de la phylogénie. Dans la classification du vivant en sept règnes, les procaryotes formaient un taxon paraphylétique, regroupant ainsi des êtres vivants partageant une structure cellulaire similaire et simple.
Organisme (physiologie)thumb|Les bactéries Escherichia coli sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution. Il est constitué d'une ou plusieurs cellules vivantes (on parle alors, respectivement, d'organisme unicellulaire ou pluricellulaire). Les organismes vivants sont classifiés en espèces partageant des caractéristiques génétiques, biologiques et morphologiques communes.
AcetogenAn acetogen is a microorganism that generates acetate (CH3COO−) as an end product of anaerobic respiration or fermentation. However, this term is usually employed in a narrower sense only to those bacteria and archaea that perform anaerobic respiration and carbon fixation simultaneously through the reductive acetyl coenzyme A (acetyl-CoA) pathway (also known as the Wood-Ljungdahl pathway). These genuine acetogens are also known as "homoacetogens" and they can produce acetyl-CoA (and from that, in most cases, acetate as the end product) from two molecules of carbon dioxide (CO2) and four molecules of molecular hydrogen (H2).
Étherlipidevignette|Structure d'un plasmalogène. vignette|Archéol. vignette|Caldarchéol. vignette|Crénarchéol. vignette|Structures d'une bicouche lipidique (9) et d'une « monocouche » propre à certaines archées (10). vignette|Facteur d'activation plaquettaire. Un étherlipide, parfois appelé alcoxyglycéride, est un glycéride dans lequel une fonction alcool du glycérol, généralement l'hydroxyle du carbone en position 1, est combinée à un alcool gras par une liaison éther, contrairement aux lipides usuels, dans lesquels les groupes hydroxyle du glycérol sont combinés à un acide gras par une liaison ester.
ThermoacidophileA thermoacidophile is an extremophilic microorganism that is both thermophilic and acidophilic; i.e., it can grow under conditions of high temperature and low pH. The large majority of thermoacidophiles are archaea (particularly the Thermoproteota and "Euryarchaeota") or bacteria, though occasional eukaryotic examples have been reported. Thermoacidophiles can be found in hot springs and solfataric environments, within deep sea vents, or in other environments of geothermal activity.
HalobacteriumHalobacterium est un genre d'archées halophiles de la famille des Halobacteriaceae. Il regroupe plusieurs espèces aérobies dont le métabolisme nécessite un environnement à forte teneur en sels dissous car de nombreuses enzymes de ces organismes sont inopérantes dans les environnements pauvres en sels. Ces cellules se présentent sous forme de bâtonnets ou de coques de couleur rouge ou violette, avec des parois cellulaires différentes de celles des bactéries car ces dernières ne résistent pas aux environnements trop riches en sels, et se développent en présence d'acides aminés en conditions aérobies.
PiézophileLes organismes piézophiles (« piezzophiles », ou « barophiles ») sont des êtres vivants qui ne peuvent vivre qu'en pression hyperbare (à des pressions très élevées) comme les bactéries et plus particulièrement les Archaea vivant dans les grands-fonds océaniques. De vertébrés, invertébrés et des micro-organismes (surtout des procaryotes) sont trouvés là où la pression dépasse souvent les (environ ). Certains de ces organismes piézophiles ont été découverts au fond de l'océan Pacifique où la pression était de .
MésophileUn organisme mésophile est une forme de vie qui prospère au mieux dans des conditions moyennes du gradient sécheresse-humidité. Classiquement, on parle de bactéries mésophiles lorsqu'elles vivent à des températures comprises entre 20 et (bactéries mésothermes) et dans des conditions moyennes d'humidité. Au point de vue de la température, les écologues distinguent trois flores : la flore cryophile (5 à 20°), mésophile (20 à 35°) et thermophile (35 à 42°). Ils distinguent aussi les espèces thermophobes, ne supportant pas des températures élevées.
Pansethumb|upright=1.4|Système digestif d'un ruminant (vache).m. œsophage, v. rumen ou panse, n. réticulum ou réseau, b. omasum ou feuillet, l. abomasum ou caillette, t. partie pylorique de la caillette. La panse, aussi appelée rumen, est le premier des quatre compartiments du système digestif des ruminants. Il est de loin le plus volumineux et joue un rôle indispensable dans la dégradation des nutriments par le processus de fermentation anaérobie par le microbiote du rumen.
Nitrificationthumb|350px|Diagramme montrant le cycle de l'azote. La nitrification est le processus biologique par lequel les nitrates sont produits dans l'environnement. Celle-ci se fait en deux étapes distinctes, chacune sous l'action de micro-organismes différents. Étape 1 : l'ammoniaque est oxydé en nitrite, c'est la nitrosation (réaction par des bactéries du genre Nitrosomonas, , ), appelée également nitritation. Étape 2 : le nitrite est oxydé en nitrate, c'est la nitratation (réaction par des bactéries du genre Nitrobacter, Nitrococcus, Nitrospira).
Respiration anaérobieLa respiration anaérobie est un mécanisme dans lequel des électrons passent sur une chaîne de transporteurs dont l'accepteur final est une substance minérale autre que le dioxygène, contrairement à une respiration aérobie où l'accepteur final est du dioxygène. Certaines bactéries sont capables, en anaérobiose, de réduire les nitrates en nitrites puis, suivant les cas (par exemple Pseudomonas) en diazote (avec l'enzyme nitrate ). Cette chaîne respiratoire est plus courte que la chaîne respiratoire classique en aérobiose.
MethanosarcinaMethanosarcina est un genre d'archées méthanogènes anaérobies dont les espèces sont parmi les seules connues à pouvoir produire du méthane par les trois modes de la méthanogenèse. La plupart des méthanogènes, dits hydrogénotrophes, produisent en effet le méthane par réduction du dioxyde de carbone à l'aide de dihydrogène , d'autres, dits acétotrophes, utilisent l'acétate par méthanogenèse acétotrophe, et les espèces du genre Methanosarcina sont également capables de métaboliser des composés organiques à un atome de carbone tels que le méthanol , le méthanethiol et la méthylamine — elles sont dites méthylotrophes.
