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Hyunjin Shim

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Publications associées (8)

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Feature Learning of Virus Genome Evolution With the Nucleotide Skip-Gram Neural Network

Recent studies reveal that even the smallest genomes such as viruses evolve through complex and stochastic processes, and the assumption of independent alleles is not valid in most applications. Advances in sequencing technologies produce multiple time-poi ...

2019

Likelihood-free Inference of Population Genetic Parameters from Time-Sampled Genetic Data

This thesis consists of five papers published in peer-reviewed journals, two of which focus on method development of time-serial inference, represented by publications in methodology journals, and three others that describe collaborative data applications ...

EPFL2018

Experimental adaptation of human echovirus 11 to ultraviolet radiation leads to tolerance to disinfection and resistance to ribavirin

Virginie Bachmann, Tamar Kohn, Hyunjin Shim, Qingxia Zhong, Jeffrey David Jensen, Anna Carratala Ripolles

Ultraviolet light in the UVC range is a commonly used disinfectant to control viruses in clinical settings and water treatment. Here, we employed an experimental evolution approach to investigate the adaptation of human echovirus 11 to disinfection by UVC, ...

2017