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Basile Isidore Martin Wicky

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Publications associées (3)

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Scaffolding protein functional sites using deep learning

Basile Isidore Martin Wicky, Jue Wang, Bruno Emanuel Ferreira De Sousa Correia, Karla Montserrat Castro Gilabert, Wayne Yang Wen Wei

The binding and catalytic functions of proteins are generally mediated by a small number of functional residues held in place by the overall protein structure. Here, we describe deep learning approaches for scaffolding such functional sites without needing ...

American Association for the Advancement of Science2022

Functional Dissection of Intersubunit Interactions in the EspR Virulence Regulator of Mycobacterium tuberculosis

Giovanni Dietler, Benjamin Blasco, Stewart Cole, Florence Pojer, Matteo Dal Peraro, Basile Isidore Martin Wicky, Aleksandre Japaridze, Marco Stenta

The nucleoid-associated protein EspR, a chromosome organizer, has pleiotropic effects on expression of genes associated with cell wall function and pathogenesis in Mycobacterium tuberculosis. In particular, EspR binds to several sites upstream of the espAC ...

American Society for Microbiology2014

TAL Effectors Specificity Stems from Negative Discrimination

Matteo Dal Peraro, Basile Isidore Martin Wicky, Marco Stenta

Transcription Activator-Like (TAL) effectors are DNA-binding proteins secreted by phytopathogenic bacteria that interfere with native cellular functions by binding to plant DNA promoters. The key element of their architecture is a domain of tandem-repeats ...

Public Library of Science2013