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Antonio Carlos Alves Meireles Filho

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Publications associées (12)

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Extensive tissue-specific expression variation and novel regulators underlying circadian behavior

Michael Vincent Frochaux, Bart Deplancke, Matteo Dal Peraro, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Roel Paulus Josephus Bevers, Alessio Prunotto, Julie Marie Russeil, Virginie Sandra Braman, Vincent Roland Julien Gardeux, Maria Litovchenko, Brian Dennis Hollis

Natural genetic variation affects circadian rhythms across the evolutionary tree, but the underlying molecular mechanisms are poorly understood. We investigated population-level, molecular circadian clock variation by generating >700 tissue-specific transc ...

2021

A parallelized, automated platform enabling individual or sequential ChIP of histone marks and transcription factors

Bart Deplancke, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Riccardo Dainese, Daniel Alpern, Vincent Roland Julien Gardeux, Gerard Llimos Aubach, Jia Yuan Jiang

Despite its popularity, chromatin immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-seq) remains a tedious (>2 d), manually intensive, low-sensitivity and low-throughput approach. Here, we combine principles of microengineering, surface chemistry, and molec ...

National Academy of Sciences2020

BRB-seq: ultra-affordable high-throughput transcriptomics enabled by bulk RNA barcoding and sequencing

David Hacker, Bastien Mangeat, Bart Deplancke, Antonio Carlos Alves Meireles Filho, Julie Marie Russeil, Daniel Alpern, Vincent Roland Julien Gardeux

Despite its widespread use, RNA-seq is still too laborious and expensive to replace RT-qPCR as the default gene expression analysis method. We present a novel approach, BRB-seq, which uses early multiplexing to produce 3 cDNA libraries for dozens of sample ...

2019