Publication

Database resources for the tuberculosis community

Stewart Cole, Jocelyne Lew, Ioannis Xenarios
2013
Reviews

Résumé

Access to online repositories for genomic and associated "-omics" datasets is now an essential part of everyday research activity. It is important therefore that the Tuberculosis community is aware of the databases and tools available to them online, as well as for the database hosts to know what the needs of the research community are. One of the goals of the Tuberculosis Annotation Jamboree, held in Washington DC on March 7th-8th 2012, was therefore to provide an overview of the current status of three key Tuberculosis resources, TubercuList (tuberculist.epfl.ch), TB Database (www.tbdb.org), and Pathosystems Resource Integration Center (PATRIC, www.patricbrc.org). Here we summarize some key updates and upcoming features in TubercuList, and provide an overview of the PATRIC site and its online tools for pathogen RNA-Seq analysis. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/1902424a-ef42-407c-9d22-53b51d60c69c

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Concepts associés (12)

Base de données

Une base de données permet de stocker et de retrouver des données structurées, semi-structurées ou des données brutes ou de l'information, souvent en rapport avec un thème ou une activité ; celles-ci peuvent être de natures différentes et plus ou moins reliées entre elles. Leurs données peuvent être stockées sous une forme très structurée (base de données relationnelles par exemple), ou bien sous la forme de données brutes peu structurées (avec les bases de données NoSQL par exemple).

Washington (district de Columbia)

Washington, officiellement le District de Columbia (), souvent appelée Washington, D.C. (), The District, ou simplement D.C. (pour éviter la confusion avec l'État de Washington), est la capitale des États-Unis. Selon les dernières estimations (2019), elle compte intra-muros sur une superficie de ; son aire urbaine en compte environ , la sixième des États-Unis, après Houston et devant Miami. Elle a le statut de ville indépendante. En tant que capitale fédérale, elle ne fait pas partie des cinquante États de l'Union et dépend directement du Congrès.

Région métropolitaine de Washington

thumb|Région métropolitaine de Washington La région métropolitaine de Washington (Washington Metropolitan Area) est une aire urbaine centrée sur Washington, la capitale des États-Unis. La zone comprend tous les districts avec les différents organismes fédéraux et certaines parties des États américains du Maryland, de la Virginie et de la Virginie-Occidentale. Le Bureau de la gestion et du budget définit la région comme la Washington–Arlington–Alexandria, DC–VA–MD–WV Metropolitan Statistical Area, une région métropolitaine utilisée à des fins statistiques par le Bureau du recensement des États-Unis et d'autres organismes fédéraux.

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