Publication

Improved microfluidic transcriptome based screening methods

Christoph Merten, Xiaoli Ma, Leonie Kolmar, Hongxing Hu
2024
Patents

Résumé

The invention provides microfluidic screening systems for the identification of compounds or compositions influencing cellular transcriptomes. The invention is predicated upon taking into account differences in newly synthesized mRNA in contrast to so called old mRNA and such differences compared to control cell assays. The invention is applicable for screening in particular candidate ligand molecules such as antibodies for an effect on target cells, and thereby provides new strategies for the identification of therapeutically active compounds.

Source officielle

https://infoscience.epfl.ch/entities/publication/bfa519c0-6aa8-401b-ba9e-19f33d901f54

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Christoph Merten, Xiaoli Ma, Leonie Kolmar, Hongxing Hu
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Virtual screening (VS) is a computational technique used in drug discovery to search libraries of small molecules in order to identify those structures which are most likely to bind to a drug target, typically a protein receptor or enzyme. Virtual screening has been defined as "automatically evaluating very large libraries of compounds" using computer programs. As this definition suggests, VS has largely been a numbers game focusing on how the enormous chemical space of over 1060 conceivable compounds can be filtered to a manageable number that can be synthesized, purchased, and tested.

Microfluidique

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Criblage à haut débit

thumb|Machine de criblage à haut débit en Allemagne Le criblage à haut débit (high-throughput screening, HTS) désigne dans le domaine de la pharmacologie, de la biochimie, de la génomique et de la protéomique, les techniques visant à étudier et à identifier dans les chimiothèques et ciblothèques, des molécules aux propriétés nouvelles, biologiquement actives. L’expression haut débit évoque ici l’utilisation de la robotique, de l’informatique et de la bio-informatique pour accélérer la phase de test des molécules, protéines, catalyseurs, etc.

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